特发性肺纤维化（IPF）是一种原因不明的渐进性肺疾病，患者常常在确诊后5年内，出现呼吸衰竭并死亡。明显的呼吸道感染和免疫抑制可显著增加该病的发病率和死亡率；而与上皮细胞完整性和宿主防御功能相关的基因多态性，也会增加患者发生IPF易感性。
为了探讨细菌在IPF发病机制和进展过程中的作用，来自英国皇家布鲁顿医院，英国国家心肺研究所的W O C Cookson医生等进行了一项研究，提示支气管肺泡灌洗（BAL）液中的细菌负荷增加是IPF患者的IPF特征；而且，可以将其用作为预测患者肺功能下降和死亡情况的指标。文章在线发表于近期的AJRCCM杂志上。
该前瞻性研究纳入了按照国际标准诊断为IPF的患者，并招募了健康的吸烟者，非吸烟者和中度慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者作为对照组。所有受试者均接受了BAL，并从其BAL液中进行了基因组DNA的分离。
通过16S rRNA PCR和焦磷酸测序技术，对细菌16S rRNA基因的v3-v5区域进行了扩增，以便用于细菌负荷的定量，以及菌落的鉴定。
该研究的主要结果为：与44例对照组受试者相比较，65例IPF患者BAL液中的细菌负荷为前者的2倍。基线细菌负荷可预测受试者的肺容积率下降速度，死亡风险，并与MUC5B粘蛋白基因rs35705950的多态性独立相关，而该基因已被证明为宿主的IPF易感性因素。
基因测序在所有受试者中共获得了912883个高质量的数据。研究者发现，与对照组相比较，患者组中有更多的流感嗜血杆菌，链球菌，以及奈瑟氏菌属和韦荣氏球菌属的某些种细菌。回归分析表明，这些特定的分类操作单元（OTUs），及其细菌负荷与IPF独立相关。
该研究结果显示，BAL液中的细菌负荷增加是IPF患者的特征；而且，其可以被用作为预测患者肺功能下降和死亡情况的指标。下一步需要有抗菌治疗试验，来明确IPF患者的细菌负荷是否为其发病原因。
