目前也有采用呼出气冷凝物（EBC）作为检测标本。该作者报道了从29例AECOPD患者的14份EBC和21份痰标本中几种细菌和病毒的检测结果。对两种标本先进行核酸提取，然后进行PCR反应。结果表明来自EBC中的结果与痰的检测结果一致性不强。病毒和肺炎链球菌的核酸仅在痰中存在，而嗜肺军团菌DNA仅在EBC中存在，在3份EBC和10份痰标本中可检测到1种以上的病原体核酸。因此，EBC价值尚需进一步研究。纤维支气管镜引导下的保护性毛刷采集下呼吸的标本，并定量分析，可作为抗细菌性感染药物应用的依据之一。但这仅能作为非病毒感染的负性依据之一，而且不能排除细菌和病毒的混合感染。
咽拭子作为上呼吸道容易获得的标本在AECOPD中的使用也较为广泛。作者收集了86例患者（平均年龄72岁，其中男性占64%）AECOPD及稳定期的咽拭子，进行14种病毒的RT-PCR反应，在44例（51%）患者中检测到病毒的核酸，22例患者为小核糖核酸病毒，7例为偏肺病毒（metapneumovirus）、8例为冠状病毒（corona virus）、2例为流感病毒A/B、2例为副流感病毒（parainfluenza）、3例为RSV。而在稳定期，仅在71例中的8例（11%）检测到病毒核酸（与AECOPD期相比，P＜0.001），而此8例中5例在AECOPD时并未检测到病毒的核酸，提示为携带性的新病毒。
在重症患者中也可以采用NPA和后鼻道拭子（PS）。作者对105例患者的107次AE标本进行分析，所使用的标本为NPA、PS、痰、血、气管内吸引物，用于检测病毒的方法为培养、免疫荧光、PCR方法，用于检测细菌的方法为常规培养。在69例（64%）患者的AECOPD中发现可能导致急性加重的病原，46例病毒培养阳性（43%），且在35例（33%）患者中为唯一病原体，在11例（10%）患者中为混合感染。可能的细菌性病原为25例（23%）。
三、病毒的检测方法
目前对于AECOPD时病毒的检测方法为病毒培养、核酸检测（PCR法）、血清学检测方法。每种方法各有利弊，金标准为培养法，但耗时耗力，阳性率低；最快速的方法为核酸检测法，但是否为本次感染的病原学难以区分；而血清学检测方法对于判断少见病毒性感染有明显优势。
Bafadhel等分析了纳入研究的145例患者中86例合格的182次急性加重标本，通过分析急性加重的原因，最终分为四类：细菌感染性、病毒感染性、嗜酸粒细胞增多性和非炎症性，结果显示病毒感染在AECOPD中占重要地位。近年来，开发了使用多重实时PCR（Multiplex real-time PCR）越来越受到关注。已报道的对于13种病毒和2种非典型病原体（衣原体和支原体）采用这种方法进行检测，所采用的标本为口因拭子。在有症状者中43%为阳性，而无症状者仅2%为阳性；在出现症状6d内的标本阳性率更高。主要检测到的病毒为人类冠状病毒、流感病毒A/B。
分离率较低的冠状病毒大多采用血清学方法，在血清学上评价作为相应感染的一个指标为配对血清呈4倍以上滴度升高。Gorse等对1998- 1999年冬天呼吸道病毒暴发流行季节，共2215例50岁以上COPD患者的下呼吸道感染标本及血清学标本进行分析，结果HCoV-229E和HCoV-OC43两个血清型的病毒在665例有流感样表现者中分离率为14%（90例次），678例下呼吸道感染的患者中分离率为16%（107例次）。但这一数据在其他分析中均未见类似报道。
病毒感染或混合感染在AECOPD中的地位显然较重要，而采用鼻病毒血清型16气道内注射于稳定期COPD患者，获得了AECOPD模型，说明鼻病毒感染是AECOPD的原因之一。然而，由于其分离和检测较细菌和真菌困难，有效药物较少，而且，在成人中的致病作用可能远未被认识，目前也鲜有大规模的、多中心研究，病例数量较多的研究。此外，由于临床上对于病毒性感染的重视性不够，且临床上尚无商业化使用于临床的病毒检测工具，因此有待于更多的研究。
